Van Yamano, un jeune garçon de 13 ans, est passionné de LBX (Little Battlers eXperience), des robots miniatures d’une puissance remarquable qui s’affrontent dans une boîte et sont télécommandés par leurs propriétaires. Malheureusement, sa mère refuse de lui en acheter un.
Un jour, Van croise une femme qui lui donne une mallette contenant un LBX. Selon elle, il s’agirait de « l’espoir de l’humanité ».
Van, avec ses amis Kazuya et Amy, va alors se retrouver entrainer dans un drôle d’engrenage.